强碱性阴树脂被污染的特征是交换容量下降，再生后正洗所需时间延长，树脂颜色常变深，除盐系统的出水水质变坏，pH值降低。凝胶型强碱性阴树脂之所以易受腐殖酸或富维酸污染，是由于其高分子骨架属于苯乙烯系，是憎水性的，而腐殖酸或富维酸也是憎水性的，因此二者之间的分子吸引力很强，难以在用强碱液再生时树脂时解吸出来，而且腐殖酸或富维酸的分子很大，移动缓慢，一旦进入树脂中后，易被卡在里面。随着时间的延长，被卡在树脂中的有机物越来越多，为强碱性阴树脂的有机物污染,应合理地采用加氯、混凝、澄清、过滤、活性炭吸附等各种水处理方法，尽量降低强碱性OH型交换器入口水中有机物的含量。
阴树脂被有机物污染程度，可用下述简易方法判断：将50mL被污染的树脂装入锥形瓶中，用纯水摇动洗涤3～4次，以去除树脂表面污物，然后加入10%食盐水，剧烈摇动5～10min后观察食盐水的颜色，按溶液色泽判别污染程度。
一般在树脂受到中度污染时即需进行复苏处理，经用多种钠盐和碱配成复苏液对污染树脂进行的试验发现，复苏液使树脂收缩程度大者复苏效果好。对于不同水质污染的阴树脂，
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阴树脂受铁污染颜色变黑，性能变坏，再生效率降低，再生剂用量与清洗水耗增加。受铁污染后的阴树脂一般也采用与阳树脂相同的酸洗办法进行处理。
值得说明的是，由于工业盐酸含铁量较高（可能以FeCl4-形态存在），当酸洗被铁污染的阴树脂时，不仅不能清洗出树脂中的铁，相反还会交换到该树脂上去。因此，酸洗被铁污染的阴树脂宜用化学纯的盐酸。
如果阴树脂既被有机物污染,又被铁离子及其氧化物污染,则应首先除去铁离子及其氧化物,而后再除去有机物。利用超声波清洗被污染的阴、阳离子交换脂是近年来应用的一项新技术。它是利用高频率的超声振动所起的空化作用，使树脂的各种污染受到松动、破坏，进而转入到水中被反洗水冲走。
